医院始建于1951年，现有大南门院区和凤凰湖院区两个院区，是国家三级甲等中医院，重庆中医药学院附属永川医院，江苏省中医院重庆医院（国家区域医疗中心）依托医院，国家中医紧急医学救援队伍和紧急医学救援基地依托中医院，国家住院中医师规范化培训基地。
医院大南门院区占地21亩，总资产近10亿元，业务用房6万平方米，编制床位870张，实际开放床位1270张，床位使用率108.56%。凤凰湖院区占地180亩，总投资约20亿元，业务用房达21万平方米。医院年门诊量83万人次，出院病人5.7万人次，手术台次1.7万余台，病人来源覆盖川渝黔十余个区县，病人满意度保持在99.2%以上。现有职工1053名，有高级专业技术人员142名，博士后、博士、硕士131名，其中博士生导师2名、硕士生导师18名；国家级、省级学术专委会委员及以上专家105名。医院现有国家级特色专科1个，国家农村医疗机构中医特色优势重点专科1个，重庆市重点学科4个，重庆市中医名科3个，重庆市重点专科10个，重庆市中医特色专科2个。医院耳鼻喉科、骨科、推拿科学科综合实力位居重庆市中医系统前列。建立国医大师李佃贵、廖品正、夏桂成学术传承工作室，岐黄学者方邦江、谈勇、沈洪传承工作室，开设毛得宏、曾朝芬全国名老中医传承工作室。
2022年5月，医院正式纳入第三批国家区域医疗中心建设项目名单，成功获得国家区域医疗中心项目建设，与输出医院江苏省中医院共建“国家区域医疗中心”。医院将以国家区域医疗中心为平台，建成五个高水平子平台。初步形成中医妇产生殖、儿科、心血管病科、脾胃病科、肾病科、肿瘤科、耳鼻喉科七大医疗服务“高地”，全面提升医院的整体水平。
